隆庆皇帝驾崩后，新帝朱翊钧登上帝位，按照旧制新帝登基后要给先帝后妃上尊号。明朝规定，天子立，尊先帝的皇后为皇太后，若有生母，而生母不是先帝的皇后，则天子的生母也称太后，只是在太后前加徽号以示区别。当时李贵妃在宫中很有势力，司礼监大太监冯保为了讨好李贵妃，就与重臣张居正在私下商议，尊先帝的陈皇后为仁圣皇太后，尊李贵妃为慈圣皇太后，这样两宫太后就没有分别了。

    自万历朝开始，先帝的皇后和新帝的生母在尊号上就不再以加徽号相区别了。冯保还与张居正商议，安排仁圣皇太后居慈庆宫，慈圣皇太后居慈宁宫。不仅如此，张居正还请求慈圣皇太后照顾新帝的起居，毕竟万历皇帝还是一个10岁的孩子。于是慈圣皇太后就名正言顺地住进了乾清宫，并且借照顾皇帝的名义逐渐干预朝政。